La mise en place d’une démarche qualité selon la norme ISO 9001 au sein du Pilier Forêt est une volonté double, d’une part de structurer notre organisation, de favoriser le partage d'expériences entre sites, et d'autre part de s'inscrire dans une démarche d'amélioration continue pour répondre au mieux aux besoins de la communauté scientifique utilisatrice de nos ressources et aux attentes de nos tutelles.

Le Manuel qualité du Pilier Forêt présente :
le Pilier Forêt,
le domaine d'application du Centre de Ressources Biologiques, c'est-à-dire le périmètre géographique et les activités concernées par la certification souhaitée,
la Politique Qualité de la structure, qui décline les objectifs, et
la cartographie des processus, qui offre une vue globale du fonctionnement du CRB. Elle permet de visualiser les processus, leurs interactions et distingue les processus métier, les processus support et les processus de management

Le Pilier Forêt est certifié sur le domaine d'application "Introduire en collection, conserver, caractériser par génotypage et distribuer des ressources biologiques forestières avec leurs données associées", depuis novembre 2021.